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用新技术排序的个人基因组图谱优缺点有待检证
2008-04-19 10:13:20

新华网伦敦4月17日电(记者葛秋芳)英国《自然》杂志17日公布了用新一代快速基因测序技术排序的个人基因组图谱。新技术更省钱省时,却没能赢得满堂彩,业界认为其优缺点还有待检证。

《自然》杂志报道说,用新一代快速基因测序技术排序的是有“DNA之父”之称的美国科学家詹姆斯·沃森的个人基因组 图谱。科学家仅用了4个月时间、不到150万美元就完成了沃森30亿个碱基对的测序工作。而人类基因组计划2003年获得的首张人类全基因组图谱,花费了4.37亿美元和13年的时间。

这项新技术遭到了一些专家的质疑。美国基因组研究先驱克雷格·文特尔说:“这是测序技术的一个新标准,但我并不认为它也是基因组覆盖和自主组装技术的新标准。”文特尔对新技术的顾虑在于,新测序技术将DNA切成更短的片断,每段仅有250个碱基。更短的片断重新组装在技术上具有更大的挑战性,也就是说,探测基因组中拥有大块重复序列的区域将变得更加困难。传统方法是使用500至1000个碱基作为片断。

华盛顿大学的遗传学家埃文·艾克勒说,对拥有大块重复序列的区域进行研究非常关键,因为5%至10%的基因组是由这种复杂的区域组成的,这些区域包含着致病基因,而且个体间差异很大,因此该区域对人类疾病基因研究很有价值。他说,新测序技术能否为人们提供这些区域中的信息,及人们对这些特定区域的了解有多深,都还是未知数。

还有专家指出,新测序技术论文的作者很大程度上是在人类基因组计划的参考序列指引下才得以重新整理出整个基因组。美国加利福尼亚大学戴维斯分校的专家乔纳森·艾森说,有关科学家下一步工作应该是证明,在没有参考的情况下,他们能用新技术把测序工作做好。

责编: 陈良来源: 新华网

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